Voor elke genetische aandoenining waarvan voldoende gegevens beschikbaar zijn kan binnen Dogbase een fokwaarde worden berekend.

Dit betekent dat een hond voor de ene aandoening een gunstige fokwaarde heeft, maar voor een andere aandoeningen een minder gunstige. Dit betekent dat selectie van deze hond als fokdier het risico op een bepaalde aandoening verkleint, terwijl het risico op een andere verhoogt. Alleen als rekening wordt gehouden met  alle beschikbare fokwaarden kan winst geboekt worden voor elk van de aandoeningen.

Om de fokwaarden van de verschillende aandoeningen mee te kunnen wegen kunnen de fokwaarden worden gecombineerd tot één fokindex.

Fokindex (hond) = fokwaarde1+ fokwaarde2 + fokwaarde3

De gemiddelde fokindex in de populatie is op 100 gesteld.

Afhankelijk van de ernst en de frequentie van de aandoening kan het fokdoel binnen het fokbeleid per aandoening echter verschillen en weegt elke aandoening niet even zwaar. Dit verschil kan in de fokindex worden meegenomen door fokwaarden (fw) van de verschillende aandoeningen (relatief) ten opzichte van elkaar in te wegen.

Fokindex (hond) = (weging) fw1+ (weging) fw2 + (weging) fw3

Het (relatieve) verschil in de wegingsfactoren wordt in overleg met de rasverenging vastgesteld op basis van het gewenst fokdoel.
Dit betekent dat wanneer een hond met een fokindex onder de 100 wordt gekozen, dit genetisch winst oplevert ten aanzien van al de drie aandoeningen.